El origen del apellido Aponte es Loca, derivado de el nombre de un lugar donde el primer  miembro de este linaje vivió o estableció casa. El apellido Aponte es el plural de la palabra Puente por lo que la casa solar de este apellido debió ser una ciudad donde abundaban los puentes.

Se le encuentra originalmente en el valle de Trucios en la provincia de Biscaya.

Algunas variaciones de este apellido son: Ponte, Ponti, Pont, Pontos, Puentes, De la Puente y mas.